Steve Zissou es uno de los oceanógrafos más famosos del mundo, un hombre reconocido y que todos respetan en su profesión, pero que no pasa por su mejor momento, pues tuvo que ver cómo un enorme tiburón blanco devoraba a uno de sus mejores amigos cuando estaban trabajando.
Steve no vive en paz consigo mismo pensando en lo que pasó, de manera que decide montar una expedición para buscar al tiburón y matarlo, vengándose así del animal.
Se supone que la venganza le va a traer paz, pero lo cierto es que la expedición no comienza bien, pues descubre que el copiloto que lleva a su lado podría ser su hijo, un hijo no reconocido y del que no había sabido nada hasta ahora.
Por si fuera poco, en la expedición también va su mujer, a la cual seguro que no le hará demasiada gracia enterarse de que su marido tuvo un hijo con otra mujer.
