Robotech: The Shadow Chronicles es una película de animación, que sirve como continuación de la serie del mismo nombre, en la que la raza humana continua inmersa en la lucha contra los terribles Invid, los cuales singuen intentando sin descanso, obtener la energía oculta de los terrestres.
Años después de que los alienígenas llegaran por primera vez a la Tierra, buscando una fuente de energía fundamental para su supervivencia, los humanos descubrieron el poder de la Protocultura. Una fuerza, de enorme potencial, que les permitió realizar proezas tan increíbles como viajar por el espacio exterior sin limitaciones, así como la creación de un maravilloso ejército de robots gigantes. Ejército que deberán utilizar para defenderse de sendas amenazas extraterrestres, que amenazaban con destruir el Planeta azul.
Cuarenta y cinco años más tarde, todo parece estar en calma. Con un conocimiento mayor de la Protocultura, se han podido desarrollar nuevas armas que protejan de forma eficaz esta energía, así como emprender nuevas misiones para recuperar a viejas glorias del pasado.